1. مصحف ابن البواب مكتوب بخط إملائي و لا يلتزم الرسم العثماني، لاحظ كلمات: العالمين، الصلاة ...
2. علامات الضبط مثل المدود غير موجودة...
3. يضع فاصلة زخرفية واحدة كل خمس آيات.
4 ـ والياء في لفظ في منقوطة
لا زلت أؤيد إثبات نقط الياء المتطرفة في المصحف ، ولست أدري العلة أو التوجيه في إزالة نقط الياء من الياء ، ولا أول من قال بذلك
فمن وجد نصاً في هذه المسألة فليكرمنا به وذلك قبل القرن الخامس
وقد اطلعت على مخطوطات قديمة للمصحف فوجدت الياء منقوطة
سقط سهوا رجلان والصواب :
قال عيسى الثعالبي : قرأت على البابلي من أولها إلى باب الاستعاذة وأجاز سائرها عن سيف الدين البصير عن عبد الحق السنباطي عن الجمال يوسف بن زكريا عن والده قراءة عليه قال قرأتها على أبي النعيم رضوان بن محمد قال أخبرنا بها أبو إسحاق التنوخي قال أخبرنا بها البدر ابن جماعة...
قال يحيى الغوثاني :
وأما شيخ الإسلام زكريا الأنصاري فقد اتصل له سماع الشاطبية منه إلى الإمام الشاطبي فقد نص في ثبته أنه قرأ الشاطبية على أبي النعيم المقرئ بسماعه لها على أبي إسحاق التنوخي البعلي وأبي الطاهر التكريتي ،
أما التنوخي فقد سمعها على البدر أبي عبد الله بن جماعة بسماعه لها على المعين...